对照样品中信号的阈值，高于该阈值的信号被认为是有效信号。默认值为1000。

测试样品中信号的阈值，高于该阈值的信号被认为是有效信号。默认值为10000。

质谱数据的ppm精度，用于匹配样品间的信号。主要由仪器类型决定。对于高分辨质谱数据。对于高分辨质谱数据，默认值为20。

质荷比相比较时允许的差值，用于匹配样品间的信号。该参数是对ppm参数的补充，可以设定为0，则只使用ppm参数。对于高分辨质谱数据，默认值为0.01。

EIC峰宽的最小值（以秒为单位）。一般设置为平均峰宽的90%。

EIC峰宽的最大值（以秒为单位）。一般设置平均峰宽的150%。

样品内信号鉴别时允许的保留时间偏差。默认值为30。

对照样品数据的噪音水平，低于该数值的信号被认定为噪音。默认值为100。

测试样品数据的噪音水平，低于该数值的信号被认定为噪音。默认值为1000。

样品中信噪比的阈值，高于该信噪比的信号被认为是有效信号。默认值为2。

峰检测时进行信号峰合并使用的参数，一般在0.6-1.2之间。默认值为1。

样品间信号匹配时允许的保留时间偏差。默认值为60。

参与加合物/源内碎裂计算的信号强度阈值，设置为0时则所有满足上述参数要求的信号都会参与计算。建议设置为略高于signal intensity threshold for samples。默认值为5000。